شبیه سازی واکنش های نفوذ-کنترل آنزیم لیگاند با اتوماسیون سلولی

در این پژوهش ما یک مدل اتوماتای سلولی عبور لیگاند بر روی سطح آنزیم به سمت جایگاه فعال را بررسی کرده ایم. روش های توزیع متفاوتی از آمینو اسیدها بر روی سطح پروتئین بررسی شده اند، برای هر توزیع الگوی آبدارشدنی خاصی بدست آمده و میانگین گام های زمانی لازم برای رسیدن لیگاند به جایگاه فعال محاسبه شده است. مقایسه نتایج نشان می دهد سرعتی که در آن لیگاند به جایگاه فعال می رسد بطور روشن، وابسته به توزیع آمینو اسید های روی سطح آنزیم است. چنین فرآیندی می تواند نفوذ لیگاند به سمت جایگاه فعال را با بالا بردن بهره وری عمل آنزیم تسهیل کند.